کد من بعد از اینکه از e.preventDefault() استفاده کردم دیگه اسکرول رو به بالا متوقف نمیشد اگرشما هم این مشکل رو دارید اینجوری حل میشه:

اسکرول و کلیک رو هم از جدا کنید و یه شرط برای وقتی که بالای صحفه میرسید اضافه کنید مثل کد زیر

$j(window).scroll(function () {
  if ($j(this).scrollTop() >= 500) {
    $j("#top").css({
      bottom: "10px",
    });
  } else {
    $j("#top").css({
      bottom: "-160px",
    });
  }
});
$j("#top").click(function (e) {
  e.preventDefault();
  var scrollTop = $j(window).scrollTop();
  if (scrollTop === 0) {
    return;
  } else {
    $j("html,body").animate(
      {
        scrollTop: 0,
      },
      1000
    );
  }
});